1840年（清道光二十年）

　　7月，大雨成灾，泗河境内段决口。是年，道宪王懿德捐修兖州城（即滋阳县城，下同），建造垛口4289个。

　　1841年（清道光二十一年）

　　11月，境内遭受水、旱、雹、虫灾害，清政府缓征受灾村庄新旧额赋。

　　1842年（清道光二十二年）

　　10月，驻海口的兖州、曹州两镇所属8营官兵1250名，“分起撤回，各守要隘，协防匪类，……以期消患未形”。

　　12月，山东省内运河淤浅，挑浅工程动工。济东、兖沂两道，分段监督催办。

　　1844年（清道光二十四年）

　　4月，山东学使殷寿彭到兖（即兖州城，下同）察看科试情况。科试3年1次。兖州府贡院童生应考者来自滋阳、宁阳、寿张、阳谷、汶上、济宁、嘉祥、金乡、鱼台9县。

　　1845年（清道光二十五年）

　　3月，巡抚黄石琴饬牧令督绅捐款重修城西北隅兖州府贡院（亦称考棚、试院），10月竣工。重修后有考房163间，考位700余个。

　　1847年（清道光二十七年）

　　12月10日，钦差户部左侍郎柏俊、刑部侍郎前任山东巡抚陈孚恩到兖审办兖州一带劫案。后将行动犯邵知文等“尽数搜拿”。

　　1850年（清道光三十年）

　　滋阳县生产绢、缎、绉、纱等丝织品5.6万匹，销路丰畅。

　　1853年（清咸丰三年）

　　4月，春荒。境内因连年遭受水、旱灾害，饥民纷纷求食，攀辕乞丐、男妇老幼十百成群，“少壮具已逃亡，老稚不能相顾，十室九空”。

　　1854年（清咸丰四年）

　　4月，派赴扬州的兖、曹等营官兵1000名，奉调回营。

　　1856年（清咸丰六年）

　　天气干旱，蝗虫成灾，翌年春荒严重。

　　1857年（清咸丰七年）

　　春，大旱，蝗虫为患，歉收甚重。知县莫炽捐款以工代赈，修挖城壕。

　　1859年（清咸丰九年）

　　前知县莫炽主持重修《滋阳县志》，黄恩彤总纂。全志分12卷、4册，历时5个月，稿成未付梓。

　　1860年（清咸丰十年）

　　9月15日，张乐行率捻军到兖州，大批穷苦农民为生活所迫参加捻军。是年，捻军达7、8万人，遍及鲁南26州县。

　　9月，文贤教在邹县揭竿起义，滋阳县南沙堆社（今兴隆庄镇）一带农民纷纷参加，义军活动于兖州城南。12月，兖州镇总兵双龄、知府张鹏志进剿，义军首领宋继鹏率部大败清军于城南。翌年春，义军再次击败兖州镇总兵富新部。

　　1861年（清咸丰十一年）

　　3月，捻军将领李成率部到兖州城西郭家潭（今前海乡郭楼村东）诈降，大败清将荣某、桂希曾等官兵。

　　5月，捻军由滕县、邹县攻占境内王因一带，进逼兖州城。夏，捻军杀死团练首领郑毓桓。

　　是年，鲁西南宋景诗的黑旗军、鲁南的幅军、淄川刘培德的起义军亦在境内一带活动。

　　1862年（清同治元年）

　　8月，山东巡抚谭迁襄驻扎兖（州）沂（州）“适中之地”，剿兰（陵）费（县）一带“幅匪”，并会合夹击白莲教义军。

秋，瘟疫流行。

　　是年，禚、夏等5家合股开设天德堂药店。

　　绅土崔广元献地在南顺城街财神阁办义学1所。

　　1863年（清同治二年）

　　4月，白劳教义军进驻境内。清政府派德楞额及驻兖各军对其进行围剿。

　　是年，贞源号钱庄在佛爷庙西街开办，有资本2500吊铜元，经营买卖金银、兑换银元、存款放款业务，亦发行钱票。1925年停业。

　　1865年（清同治四年）

　　3月7日，捻军首领任化帮、赖文光率部在垛庄一带大败清兵，兖州总兵范正担只身逃回兖州城。

　　1867年（清同治六年）

　　夏，大雨，泗河决口，境内受灾。

　　10月，捻军进入山东境内，从兰陵经邹县向曲阜，滋阳县境推进。

　　1870年（清同治九年）

　　城内恒泰茶庄开业。有雇员9人，资金4万元。

　　张永恩在估衣市街开办公利号钱庄，时有贞源号、公利号、华盛号钱庄3家。

　　1874年（清同治十三年）

　　穆凯元创办元盛永布店在城内开业。

　　1875年（清光绪元年）

　　王府亭开设大德堂药店。雇员5人，地址在中御桥东路南。

　　1876年（清光绪二年）

　　春、夏大旱，禾苗枯死，发生严重饥荒。翌年春连续干旱。

　　是年，元盛和布店开业，有雇员5人。资金3万元。

　　1878年（清光绪四年）

　　贵兴永线庄开业。当时兖州城内有商号180余家。

　　1881年（清光绪七年）

　　秋，大雨，泗河溢，境内作物受灾。

　　是年，德国传教士安治泰欲占城内钟楼街建教堂，遭到当地百姓抵制，遂罢。

　　1883年（清光绪九年）

　　李德新创办德和百货店开业，有雇员13人，兼营文化用品。

　　知府伊勒通阿召集绅耆捐款重修兖州城，翌掉竣工。

　　1884年（清光绪十年）

　　兖州府开设电报局。

　　1885年（清光绪十一年）

　　8月，大旱，蝗虫为患，秋禾歉收。

　　1886年（清光绪十二年）

　　庠生王玉屏捐资，在城东南隅办义学1所。

　　城内中御桥北陈孝格考中进士，留京任“户部主事”。其诗稿数百首，后人整理编成《养松堂遗诗》，1921年铅印出版。

　　1887年（清光绪十三年）

　　8月上旬，安治泰再次到兖建教堂，遭到抵制。21日拔贡汤浩、绅士范宝真率民众痛斥安治泰。为阻止其购地建教堂赶跑卖主、中人、封锁城门。自此，“兖州教案”历时10余年之久。

　　1888年（清光绪十四年）

　　6月13日，渤海湾发生5.5级地震，波及境内。

　　是年，前知县李光霖续修《滋阳县志》，共14卷，刻印。

　　灾情严重，秋禾无收，民大饥。

　　张福臣开办义聚福杂货店，宋同凤开办广泰昌百货店相继开业。

　　1890年（清光绪十六年）

　　夏、秋、黄河、运河、泗河泛滥，冲塌房屋，死人无计。清廷拨粮5万石、库银10万两赈济灾民。

　　是年，知县周衍恩创设崇正书院，院址在城内息马地街，俗称西书院。

　　1892年（清光绪十八年）

　　进士王景禧（兖州城里人）朝考一等，授翰林院编修。1897年授任顺天乡试同考官兼国史馆协修。

　　兖州人宋某织于粤东，回兖习传其艺，改织布机创织小缎成功。小缎匹长2丈4尺，宽1尺6寸至2尺2寸。年织约万余匹。

　　1894年（清光绪二十年）

　　田恩来任兖州镇守使兼总兵。

　　在东书院门外府河上修登瀛桥1座。

　　1895年（清光绪二十一年）

　　武术教师薛某，在薛朱刘、包家村、吴家村等发展义和团组织。

　　1897年（清光绪二十三年）

　　德国传教士以“巨野教案”清政府赔款在兖州城西南隅建教堂。教堂占地8万余平方米，主楼大圣堂（礼拜堂）高21米。1899年建成。后，天主教总堂由阳谷迁至兖州。

　　天主教堂外籍神职人员使用四轮小汽车往返于教区，为境内第一部汽车。

　　1898年（清光绪二十四年）

　　美国基督教“美以美会”开始在兖州活动。

　　1899年（清光绪二十五年）

　　兖州府设立兖州邮政局，辖12县邮政业务。

　　1901年（清光绪二十七年）

　　德国天主教堂附设的保禄印书馆建成开业，专事承印各类宗教印刷品。

　　1902年（清光绪二十八年）

　　4月，知县徐赓熙编著《蚕桑辑要略编》曲阜县知县向植作序，刻印成册。

　　1903年（清光绪二十九年）

　　赵仰献创办琴记雪茄烟厂，有资本1.4万元。大中、华美、春华、金声、万兴等10余家雪茄烟作坊相继建成。琴记烟厂、大中作坊最负盛名。

　　1904年（清光绪三十年）

　　10月，官办滋阳习艺所创建，产品有小缎、板绫、维纱。

　　是年，兖州府中学堂创建，杨宗岱任学堂监督，堂址在旧道署（今兖州酒厂址）。该学堂1913年合并于山东省立济宁七中。

　　县第一所小学堂创立，附设在兖州府中学堂内，1912年迁至崇正书院，称滋阳县立第一高等小学校。

　　1905年（清光绪三十一年）

　　清廷废除科举制，推行学堂教育。翌年，县设立劝学所，管教育行政。

　　1906年（清光绪三十二年）

　　3月，兖州蚕桑学堂创办，9月改为兖州初等农业学堂，校址在东鲁书院（今公安局址），有学生甲班16名，乙班22名。

　　8月，县第一所官办农村初级小学——范家堂初级小学堂成立。有教学班4个，学生70人。

　　是年，周元英编修《滋阳县乡土志》，4卷，未梓。（抄本今存山东省博物馆）。

　　山东巡抚杨士骧到滋阳县视察废科举兴学堂情况。

　　1970年（清光绪三十三年）

　　滋阳县孔学会成立，陈培基任会长。会址在县文庙（今六中址）。

　　1909年（清宣统元年）

　　4月，津浦铁路兖（州）济（南）段及兖州府站动工兴建。1911年8月津浦铁路兖济段建成。

　　8月，英国人强占旧皇城大片土地，建基督教中华圣公会教堂（今兖州一中址）。有礼堂、会客厅、配房等1461间。

　　是年，兖州飞机场场始建，位于玻璃厂村南。

　　蒙养小学堂成立，在文庙崇圣祠内（今六中院东北隅）。

　　1910年（清宣统二年）

　　滋阳县私立保华小学成立。

　　同昌纸店开业。

　　1911年（清宣统三年）

　　泗河铁路大桥始建。位于兖州城东南，南北走向，为铁路单行线，钢架石墩结构，全长300米。1912年11月建成投用。

　　兖（州）济（宁）铁路支线动工铺筑。

　　辛亥革命爆发，驻城清朝官员惶恐不安。

　　天主教会设立滋阳县私立育德小学，地址在钟楼街。